43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4231 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4231  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  330  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2053  3-dehydroquinate dehydratase  51.2 
 
 		 187 aa  160  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1987  hypothetical protein  53.75 
 
 		 182 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0869  hypothetical protein  49.7 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2557  hypothetical protein  53.59 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3002  hypothetical protein  46.31 
 
 		 312 aa  120  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.935893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1074  hypothetical protein  46.32 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.847783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1092  hypothetical protein  34.9 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2276  hypothetical protein  37.5 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5082  3-dehydroquinate dehydratase  35.57 
 
 		 195 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0989  hypothetical protein  34.23 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0923234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2896  hypothetical protein  35.95 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2724  hypothetical protein  40.52 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2951  hypothetical protein  40.79 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6153  hypothetical protein  40.13 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0294  hypothetical protein  37.25 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0270  hypothetical protein  37.25 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5201  hypothetical protein  36.73 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1193  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4320  hypothetical protein  37.93 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0356129  normal  0.0779574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5867  molybdenum transport component, ATP-binding protein ModC  33.97 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4317  hypothetical protein  34.84 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000958638  normal  0.0413497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0960  hypothetical protein  35.33 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0933  hypothetical protein  34.9 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0467352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3410  hypothetical protein  35.57 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0852  hypothetical protein  36.05 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1479  hypothetical protein  33.14 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0135  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1187  hypothetical protein  36.24 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.963781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3672  hypothetical protein  31.58 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3844  hypothetical protein  34.39 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5674  hypothetical protein  36.24 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2076  hypothetical protein  32.88 
 
 		 196 aa  63.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1055  hypothetical protein  37.33 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4647  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0979  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0204451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1578  hypothetical protein  31.47 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2477  hypothetical protein  30.82 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.843664  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1988  hypothetical protein  30.83 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5508  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2747  hypothetical protein  32.64 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5394  hypothetical protein  31.3 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>