46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5867 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5867  molybdenum transport component, ATP-binding protein ModC  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4317  hypothetical protein  54.29 
 
 		 196 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000958638  normal  0.0413497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1187  hypothetical protein  56.89 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.963781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1193  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  55.49 
 
 		 196 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1055  hypothetical protein  52.98 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3672  hypothetical protein  41.25 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0852  hypothetical protein  39.76 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5394  hypothetical protein  37.35 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5201  hypothetical protein  37.13 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3002  hypothetical protein  37.74 
 
 		 312 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.935893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0135  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4320  hypothetical protein  37.13 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0356129  normal  0.0779574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1988  hypothetical protein  37.14 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3844  hypothetical protein  37.35 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1479  hypothetical protein  33.73 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3221  hypothetical protein  38.55 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3410  hypothetical protein  35.06 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217104  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0933  hypothetical protein  34.48 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0467352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0960  hypothetical protein  37.28 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2477  hypothetical protein  36.53 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.843664  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2896  hypothetical protein  36.42 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0979  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  31.71 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0204451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1074  hypothetical protein  37.59 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.847783  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0294  hypothetical protein  35.8 
 
 		 178 aa  97.8  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0270  hypothetical protein  35.8 
 
 		 178 aa  97.8  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2557  hypothetical protein  41.04 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5508  hypothetical protein  38.57 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1987  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2076  hypothetical protein  39.71 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4647  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  37.74 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2747  hypothetical protein  35.71 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5674  hypothetical protein  33.96 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2053  3-dehydroquinate dehydratase  33.14 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5195  hypothetical protein  41.07 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2276  hypothetical protein  34.36 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1578  hypothetical protein  31.45 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2951  hypothetical protein  40.14 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.568018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6153  hypothetical protein  39.46 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1092  hypothetical protein  29.86 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4231  hypothetical protein  35.34 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.658834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5082  3-dehydroquinate dehydratase  28.4 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2724  hypothetical protein  34.1 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0966  hypothetical protein  39.29 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0989  hypothetical protein  30.07 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0923234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4441  hypothetical protein  29.37 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0869  hypothetical protein  31.29 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>