34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1806 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1806  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.465275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  71.19 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  65.52 
 
 
73 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  78.18 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  66.04 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  74.36 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  54.69 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  58.46 
 
 
62 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  60.71 
 
 
74 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  56.9 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  57.81 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0326  hypothetical protein  61.4 
 
 
76 aa  53.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469377  normal  0.154186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5219  protein of unknown function DUF1674  61.76 
 
 
68 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  56.6 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0155  hypothetical protein  77.78 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  66.67 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  77.78 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2962  hypothetical protein  60.29 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671489  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1331  hypothetical protein  50 
 
 
59 aa  48.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0198  hypothetical protein  62.5 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.24053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  70 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0088  hypothetical protein  60 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618149  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0026  hypothetical protein  73.08 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0588676  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0716  hypothetical protein  68.42 
 
 
73 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4777  hypothetical protein  42.25 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  60.61 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1328  hypothetical protein  76 
 
 
70 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0485  protein of unknown function DUF1674  63.64 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0377  hypothetical protein  45 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0341  hypothetical protein  45 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0550  hypothetical protein  72 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3578  hypothetical protein  46.03 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0521  protein of unknown function DUF1674  67.86 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.236174  normal  0.217481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>