15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3578 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3578  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1331  hypothetical protein  64.29 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  74.19 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  52.94 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  47.22 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  43.84 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0198  hypothetical protein  70.37 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.24053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0326  hypothetical protein  65.52 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469377  normal  0.154186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1534  protein of unknown function DUF1674  45.61 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  58.06 
 
 		 57 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0155  hypothetical protein  66.67 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  42.19 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0026  hypothetical protein  68 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0588676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0716  hypothetical protein  66.67 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4777  hypothetical protein  62.96 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.795745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>