35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3034 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  100 
 
 		 74 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  68.52 
 
 		 62 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  60.34 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  79.41 
 
 		 57 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  81.25 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0088  hypothetical protein  70.27 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  55.56 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  54.55 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  58.93 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  51.32 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  54.9 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  48.44 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  46 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  43.06 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  54.35 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  50 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4777  hypothetical protein  67.86 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1091  hypothetical protein  55.56 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117403  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1812  hypothetical protein  50.68 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1745  hypothetical protein  52.11 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1806  hypothetical protein  68.57 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.465275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4244  protein of unknown function DUF1674  61.76 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0959773 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0377  hypothetical protein  60 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0341  hypothetical protein  60 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1534  protein of unknown function DUF1674  64.71 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0026  hypothetical protein  72 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0588676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0326  hypothetical protein  70.37 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469377  normal  0.154186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  54.84 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1026  hypothetical protein  69.23 
 
 		 92 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.0733944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0485  protein of unknown function DUF1674  58.97 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3578  hypothetical protein  42.19 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1331  hypothetical protein  62.96 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0155  hypothetical protein  62.96 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0198  hypothetical protein  62.96 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.24053  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0550  hypothetical protein  69.23 
 
 		 75 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>