31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00605 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1534  protein of unknown function DUF1674  53.57 
 
 
56 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  54.72 
 
 
58 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  68.57 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0088  hypothetical protein  74.19 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618149  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1331  hypothetical protein  85.19 
 
 
59 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  46 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  78.57 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  78.57 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3578  hypothetical protein  52.94 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0341  hypothetical protein  44 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0377  hypothetical protein  44 
 
 
72 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4777  hypothetical protein  71.43 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  67.86 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  46.51 
 
 
70 aa  48.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  70 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_004310  BR1812  hypothetical protein  71.43 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1745  hypothetical protein  71.43 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  64.52 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  55.81 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1806  hypothetical protein  70 
 
 
65 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.465275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4244  protein of unknown function DUF1674  71.43 
 
 
74 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0959773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  55 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  60 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1091  hypothetical protein  66.67 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117403  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  44.68 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0198  hypothetical protein  70.37 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.24053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0326  hypothetical protein  65.52 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469377  normal  0.154186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0155  hypothetical protein  66.67 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2927  protein of unknown function DUF1674  48.21 
 
 
52 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.479458  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  65.38 
 
 
72 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>