33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3416 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  136  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  54.29 
 
 
62 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  51.43 
 
 
68 aa  67  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  64.91 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  60.71 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  62.26 
 
 
66 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  54.29 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  58.49 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  64.1 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  64.15 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  54.55 
 
 
74 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0088  hypothetical protein  71.79 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618149  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  55.74 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1091  hypothetical protein  56.52 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117403  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  64.29 
 
 
57 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1812  hypothetical protein  62.26 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  65.62 
 
 
62 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1745  hypothetical protein  62.26 
 
 
72 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1806  hypothetical protein  77.78 
 
 
65 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.465275 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  46.51 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0326  hypothetical protein  58.49 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469377  normal  0.154186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4777  hypothetical protein  70.37 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2962  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671489  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0026  hypothetical protein  65.38 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0588676  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0155  hypothetical protein  58.82 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1328  hypothetical protein  72 
 
 
70 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  66.67 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0716  hypothetical protein  77.27 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0198  hypothetical protein  60.71 
 
 
72 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.24053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5219  protein of unknown function DUF1674  56.36 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1331  hypothetical protein  62.96 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0485  protein of unknown function DUF1674  60 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4244  protein of unknown function DUF1674  62.96 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0959773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>