20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1534 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1534  protein of unknown function DUF1674  100 
 
 		 56 aa  115  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  53.57 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0377  hypothetical protein  55.77 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0341  hypothetical protein  53.85 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  70 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  62.5 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  45.61 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1812  hypothetical protein  73.08 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  64.71 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1745  hypothetical protein  76 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1091  hypothetical protein  63.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3578  hypothetical protein  45.61 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1331  hypothetical protein  39.62 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  65.38 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  68 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4244  protein of unknown function DUF1674  68 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0959773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0088  hypothetical protein  72 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  65.38 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  65.38 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>