25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4244 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4244  protein of unknown function DUF1674  100 
 
 
74 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0959773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  90.54 
 
 
74 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  62.86 
 
 
76 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  62.32 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  64.52 
 
 
62 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  61.82 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  62.26 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  59.26 
 
 
74 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1091  hypothetical protein  57.97 
 
 
69 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  55.56 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1812  hypothetical protein  66.67 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1745  hypothetical protein  66.67 
 
 
72 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  64.52 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  53.45 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  57.5 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2962  hypothetical protein  49.18 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671489  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  62.26 
 
 
57 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0377  hypothetical protein  42.55 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0341  hypothetical protein  64 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1534  protein of unknown function DUF1674  68 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5219  protein of unknown function DUF1674  49.15 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0088  hypothetical protein  58.33 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618149  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4777  hypothetical protein  58.18 
 
 
71 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  47.83 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>