26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1812 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1812  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1745  hypothetical protein  98.61 
 
 
72 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1091  hypothetical protein  80.56 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117403  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  76.47 
 
 
68 aa  77  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  70.59 
 
 
66 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  70.59 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  64.71 
 
 
74 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  65.38 
 
 
62 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  50.68 
 
 
74 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  66.67 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  58.18 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0088  hypothetical protein  71.43 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618149  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  64.15 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  52.94 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  46 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4244  protein of unknown function DUF1674  66.67 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0959773 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0377  hypothetical protein  76 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0341  hypothetical protein  76 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  42.11 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  58.49 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1534  protein of unknown function DUF1674  69.7 
 
 
56 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  60 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1328  hypothetical protein  72 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  60.71 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  52.94 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3578  hypothetical protein  43.75 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>