20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0377 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0377  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  150  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0341  hypothetical protein  98.61 
 
 
72 aa  148  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1534  protein of unknown function DUF1674  55.77 
 
 
56 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  44 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  44.26 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  46.43 
 
 
76 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  80 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1812  hypothetical protein  76 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1745  hypothetical protein  76 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  60 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1091  hypothetical protein  72 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117403  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  61.54 
 
 
58 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  65.38 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1331  hypothetical protein  61.54 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  48.94 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0088  hypothetical protein  72 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618149  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4244  protein of unknown function DUF1674  64 
 
 
74 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0959773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  65.38 
 
 
62 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  64 
 
 
57 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>