37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2072 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  153  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  66.04 
 
 
70 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1806  hypothetical protein  78.18 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.465275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  55.71 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  68.18 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  65.45 
 
 
62 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  56.45 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  62.5 
 
 
72 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  50.68 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  53.73 
 
 
73 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00605  hypothetical protein  68.57 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0088  hypothetical protein  66.67 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618149  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  60 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  53.97 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  82.14 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4039  hypothetical protein  66.67 
 
 
57 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0198  hypothetical protein  77.78 
 
 
72 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.24053  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0155  hypothetical protein  74.07 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  50.91 
 
 
66 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0326  hypothetical protein  58.62 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469377  normal  0.154186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0026  hypothetical protein  73.08 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0588676  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4777  hypothetical protein  67.86 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1331  hypothetical protein  63.64 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2858  hypothetical protein  67.86 
 
 
58 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5219  protein of unknown function DUF1674  54.39 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0377  hypothetical protein  45.1 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0341  hypothetical protein  45.1 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1091  hypothetical protein  41.79 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2962  hypothetical protein  52.63 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671489  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0716  hypothetical protein  73.91 
 
 
73 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1534  protein of unknown function DUF1674  65.38 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1745  hypothetical protein  60.71 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1328  hypothetical protein  72 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163816 
 
 
-
 
NC_004310  BR1812  hypothetical protein  60.71 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4244  protein of unknown function DUF1674  64.29 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0959773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3578  hypothetical protein  62.96 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0485  protein of unknown function DUF1674  68 
 
 
70 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>