26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5219 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5219  protein of unknown function DUF1674  100 
 
 
68 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2962  hypothetical protein  91.18 
 
 
68 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671489  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0485  protein of unknown function DUF1674  68.18 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  56.45 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  50.75 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1806  hypothetical protein  67.65 
 
 
65 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.465275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  53.97 
 
 
73 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  54.39 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  50.85 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  50 
 
 
74 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  55.17 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  55.56 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0550  hypothetical protein  84 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1026  hypothetical protein  88 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.0733944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  49.3 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0521  protein of unknown function DUF1674  90.91 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.236174  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  57.89 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  67.86 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0326  hypothetical protein  53.33 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469377  normal  0.154186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1091  hypothetical protein  58.18 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117403  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1328  hypothetical protein  72 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163816 
 
 
-
 
NC_004310  BR1812  hypothetical protein  58.18 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1745  hypothetical protein  58.18 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1534  protein of unknown function DUF1674  56.25 
 
 
56 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1104  hypothetical protein  65.38 
 
 
62 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.572981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>