20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0521 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0521  protein of unknown function DUF1674  100 
 
 
75 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.236174  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0485  protein of unknown function DUF1674  82.67 
 
 
70 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0550  hypothetical protein  82.67 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2962  hypothetical protein  77.19 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671489  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5219  protein of unknown function DUF1674  75.44 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  55.38 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  47.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  60 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  46.48 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1026  hypothetical protein  81.48 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.0733944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  54.84 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  46.67 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  47.62 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  45.33 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  54.55 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  63.33 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1328  hypothetical protein  77.27 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1806  hypothetical protein  64.91 
 
 
65 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.465275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>