20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0550 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0550  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  144  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0485  protein of unknown function DUF1674  97.14 
 
 		 70 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0521  protein of unknown function DUF1674  82.67 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.236174  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2922  hypothetical protein  54.93 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5219  protein of unknown function DUF1674  69.7 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2962  hypothetical protein  69.7 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671489  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4297  hypothetical protein  55.22 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3193  hypothetical protein  52.11 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0070  hypothetical protein  56.9 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3416  hypothetical protein  57.89 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.972665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1026  hypothetical protein  81.67 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.0733944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3919  protein of unknown function DUF1674  52.63 
 
 		 74 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00556977  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2766  hypothetical protein  55.36 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3034  protein of unknown function DUF1674  55.36 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.349071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0032  protein of unknown function DUF1674  57.89 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0087  hypothetical protein  46.67 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1425  protein of unknown function DUF1674  55.56 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2072  hypothetical protein  58.33 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1328  hypothetical protein  72 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1806  hypothetical protein  64.91 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.465275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>