20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5301 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5301  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5014  hypothetical protein  70.08 
 
 		 127 aa  167  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4907  hypothetical protein  65.44 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4142  hypothetical protein  59.59 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6058  hypothetical protein  57.82 
 
 		 169 aa  154  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3544  hypothetical protein  59.57 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4244  hypothetical protein  66.39 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000183557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4795  hypothetical protein  58.62 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4115  hypothetical protein  67.44 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0256902  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4387  hypothetical protein  42.54 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3827  ribonuclease P protein component  37.8 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  34.13 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4464  ribonuclease P  31.75 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3988  ribonuclease P protein component  31.75 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  35.35 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0002  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.699533  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  31.2 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0302  ribonuclease P protein component  34.13 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0105  ribonuclease P protein component  34.11 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  30.51 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>