14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4907 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4907  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  273  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4115  hypothetical protein  72.48 
 
 		 110 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0256902  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5301  hypothetical protein  65.89 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5014  hypothetical protein  59.7 
 
 		 127 aa  143  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4142  hypothetical protein  54 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3544  hypothetical protein  54.48 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6058  hypothetical protein  54.41 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4795  hypothetical protein  53.57 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4244  hypothetical protein  58.47 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000183557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4387  hypothetical protein  37.23 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3827  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  32.99 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  32.47 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456921 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  32.56 
 
 		 140 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>