19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5014 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_5014  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  249  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5301  hypothetical protein  70.49 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4795  hypothetical protein  62.76 
 
 
176 aa  158  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4142  hypothetical protein  62.33 
 
 
157 aa  157  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6058  hypothetical protein  63.83 
 
 
169 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3544  hypothetical protein  63.12 
 
 
157 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4907  hypothetical protein  59.7 
 
 
136 aa  143  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4244  hypothetical protein  61.16 
 
 
136 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000183557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4115  hypothetical protein  51.85 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0256902  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4387  hypothetical protein  37.06 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3827  ribonuclease P protein component  41.41 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  32.54 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4464  ribonuclease P  36.36 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3988  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0002  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.699533  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  36.59 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
385 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>