18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4142 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4142  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3544  hypothetical protein  99.36 
 
 		 157 aa  310  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6058  hypothetical protein  70.07 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4795  hypothetical protein  68.46 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5014  hypothetical protein  62.33 
 
 		 127 aa  157  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5301  hypothetical protein  59.57 
 
 		 139 aa  151  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4244  hypothetical protein  58.45 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000183557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4907  hypothetical protein  54 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4115  hypothetical protein  61.25 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0256902  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4387  hypothetical protein  39.29 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3827  ribonuclease P protein component  38.97 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  30.61 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  31.29 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  29.17 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0002  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 		 131 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.699533  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3988  ribonuclease P protein component  33.7 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4464  ribonuclease P  33.7 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0853749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>