34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3827 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3827  ribonuclease P protein component  100 
 
 
135 aa  265  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4387  hypothetical protein  48.06 
 
 
156 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6058  hypothetical protein  38.81 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5014  hypothetical protein  41.41 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4142  hypothetical protein  38.97 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0002  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.699533  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5301  hypothetical protein  37.4 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3544  hypothetical protein  38.35 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  36.8 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4795  hypothetical protein  39.39 
 
 
176 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4907  hypothetical protein  36.84 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  35.25 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3988  ribonuclease P protein component  32.31 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4464  ribonuclease P  32.31 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4244  hypothetical protein  37.19 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000183557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
385 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3462  ribonuclease P protein component  32.79 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3237  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.254569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4115  hypothetical protein  39.51 
 
 
110 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0256902  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3399  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2846  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.752825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2239  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0091  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3552  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0302  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0105  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3217  ribonuclease P protein component  30.69 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3156  ribonuclease P protein component  30.69 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2551  ribonuclease P protein component  30.69 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3165  ribonuclease P protein component  30.69 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6522  ribonuclease P protein  30.69 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3183  ribonuclease P protein component  31.68 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3101  ribonuclease P protein component  43.14 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0709516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>