36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4387 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4387  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3827  ribonuclease P protein component  48.06 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4142  hypothetical protein  39.29 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3544  hypothetical protein  39.85 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5301  hypothetical protein  42.64 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5014  hypothetical protein  37.06 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6058  hypothetical protein  37.14 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4795  hypothetical protein  36.81 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4244  hypothetical protein  37.7 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000183557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4907  hypothetical protein  37.23 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4115  hypothetical protein  39.19 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0256902  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0302  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0105  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3237  ribonuclease P protein component  33.79 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.254569  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3988  ribonuclease P protein component  31.51 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4464  ribonuclease P  31.51 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3552  ribonuclease P protein component  33.79 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0091  ribonuclease P protein component  33.79 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2239  ribonuclease P protein component  33.79 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3399  ribonuclease P protein component  33.79 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2846  ribonuclease P protein component  33.79 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.752825  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  33.59 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3217  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6522  ribonuclease P protein  33.79 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3165  ribonuclease P protein component  33.79 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2551  ribonuclease P protein component  33.79 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3183  ribonuclease P protein component  33.79 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  33.66 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3156  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0002  ribonuclease P protein component  33.68 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.699533  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  30.71 
 
 		 385 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3101  ribonuclease P protein component  40.22 
 
 		 101 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0709516 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4203  ribonuclease P protein  32.73 
 
 		 123 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0154701  decreased coverage  0.00202105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2826  ribonuclease P protein component  52.27 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2333  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>