19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4795 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4795  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  343  7e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4142  hypothetical protein  66.67 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3544  hypothetical protein  70.21 
 
 		 157 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6058  hypothetical protein  61.59 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5014  hypothetical protein  62.76 
 
 		 127 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5301  hypothetical protein  59.86 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4244  hypothetical protein  54.41 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000183557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4907  hypothetical protein  53.57 
 
 		 136 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4115  hypothetical protein  47.37 
 
 		 110 aa  98.2  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0256902  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4387  hypothetical protein  35.14 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3827  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  44.87 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  37.27 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0002  ribonuclease P protein component  41.56 
 
 		 131 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.699533  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  30.39 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 169 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  33.01 
 
 		 385 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3988  ribonuclease P protein component  35.06 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4464  ribonuclease P  35.06 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0853749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>