13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4244 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4244  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  270  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000183557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5301  hypothetical protein  65.55 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4142  hypothetical protein  58.45 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5014  hypothetical protein  61.16 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3544  hypothetical protein  59.38 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4795  hypothetical protein  54.41 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6058  hypothetical protein  53.49 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4907  hypothetical protein  58.47 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4115  hypothetical protein  63.74 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0256902  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4387  hypothetical protein  37.7 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3827  ribonuclease P protein component  37.19 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  39.47 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  31.96 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>