More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0135 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3641  acylamide amidohydrolase  89.5 
 
 
345 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369711  normal  0.0367769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0135  acylamide amidohydrolase  100 
 
 
344 aa  721    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4905  acylamide amidohydrolase  91.84 
 
 
345 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1958  acylamide amidohydrolase  82.65 
 
 
345 aa  624  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3117  acylamide amidohydrolase  81.69 
 
 
347 aa  620  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3614  acylamide amidohydrolase  82.16 
 
 
346 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.580069  normal  0.0659972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1842  acylamide amidohydrolase  80.94 
 
 
345 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849454  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3739  acylamide amidohydrolase  81.47 
 
 
341 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4629  acylamide amidohydrolase  81.47 
 
 
341 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5675  acylamide amidohydrolase  81.47 
 
 
341 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0463  acylamide amidohydrolase  81.12 
 
 
339 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.374834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0571  acylamide amidohydrolase  81.18 
 
 
345 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3563  acylamide amidohydrolase  81.66 
 
 
370 aa  597  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1592  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  81.47 
 
 
347 aa  598  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3681  acylamide amidohydrolase  81.66 
 
 
350 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3372  acylamide amidohydrolase  81.66 
 
 
350 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.456501  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5504  acylamide amidohydrolase  79.88 
 
 
351 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0600  acylamide amidohydrolase  79.88 
 
 
348 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298294  hitchhiker  0.0097347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1764  acylamide amidohydrolase  78.53 
 
 
346 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3862  acylamide amidohydrolase  78.7 
 
 
348 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.897958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20560  acylamide amidohydrolase  78.53 
 
 
346 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000697662  normal  0.516157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2141  acylamide amidohydrolase  76.54 
 
 
347 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1942  Amidase  75.88 
 
 
345 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2307  acylamide amidohydrolase  72.07 
 
 
347 aa  528  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422891  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54969  aliphatic amidase  70.41 
 
 
357 aa  505  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1590  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  37.13 
 
 
331 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1114  formamidase  36.14 
 
 
342 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3851  formamidase  37.07 
 
 
332 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3682  formamidase  37.07 
 
 
332 aa  205  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3699  formamidase  37.07 
 
 
332 aa  205  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4149  formamidase  37.07 
 
 
332 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3954  formamidase  37.07 
 
 
332 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4041  formamidase  36.73 
 
 
332 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1889  formamidase  37.66 
 
 
334 aa  202  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.138385  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1704  formamidase  35.24 
 
 
342 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.2925 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45451  formamidase  35.71 
 
 
342 aa  199  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2023  formamidase  36.51 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0453204  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6454  formamidase  36.36 
 
 
338 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37022  normal  0.0467155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2134  formamidase  37.28 
 
 
340 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1198  formamidase  36.05 
 
 
332 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1357  aliphatic amidase  32.89 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2611  formamidase  36.62 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.351013  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1166  formamidase  33.44 
 
 
338 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.495916  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5655  formamidase  36.36 
 
 
338 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4054  formamidase  37.78 
 
 
207 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.603683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7479  putative hydrolase  30.14 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1875  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  35.38 
 
 
298 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4736  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  28.68 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.923409  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4057  formamidase  36.61 
 
 
129 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2842  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.35 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2588  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.67 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.581907  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2944  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.18 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2760  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.63 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17730  hypothetical protein  31.82 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3846  carbon-nitrogen hydrolase family protein  29.24 
 
 
271 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1543  hypothetical protein  31.82 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3208  putative nitrilase/cyanide hydratase family protein (carbon-nitrogen hydrolase)  25.58 
 
 
579 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22960  Nitrilase/cyanide hydratase  27.83 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1638  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.51 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00765583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3613  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  26.64 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5155  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.73 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4513  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.2 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142068  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3536  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.33 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000952449  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3063  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  23.64 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2669  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28 
 
 
579 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3529  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.75 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.714914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0207  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.77 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000351611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3474  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.87 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.228564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3867  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.8 
 
 
557 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6647  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.11 
 
 
285 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124349  normal  0.09515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3327  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.13 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4557  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.14 
 
 
273 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1311  putative carbon-nitrogen hydrolase  28.41 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.852346  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4372  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3994  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0112  putative amidase  27.35 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1731  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  27.14 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0938279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0382  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.66 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0408  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  28.68 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4306  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.85 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150232  hitchhiker  0.00451194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3496  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.04 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3509  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.283062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3578  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0936  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.91 
 
 
557 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24210  predicted amidohydrolase  28.89 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0029  carbon-nitrogen family hydrolase  30.05 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214118  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2118  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.81 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.556726  normal  0.0624833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1017  amidohydrolase  25.48 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4821  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.6 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.97612 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5694  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.11 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362224  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3875  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.41 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0597  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.88 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0406  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.24 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0030  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.89 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1648  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.64 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0061  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3014  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 
579 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1510  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  23.74 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0203  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.88 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7123  D-N-carbamoylase  31.43 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>