More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1114 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1704  formamidase  92.98 
 
 
342 aa  677    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.2925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2023  formamidase  92.98 
 
 
342 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0453204  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1114  formamidase  100 
 
 
342 aa  710    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6454  formamidase  80.65 
 
 
338 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37022  normal  0.0467155 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5655  formamidase  82.18 
 
 
338 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1166  formamidase  74.7 
 
 
338 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.495916  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1357  aliphatic amidase  73.17 
 
 
338 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1590  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  72.12 
 
 
331 aa  518  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45451  formamidase  71.01 
 
 
342 aa  511  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3851  formamidase  49.85 
 
 
332 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3682  formamidase  49.85 
 
 
332 aa  349  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3699  formamidase  49.85 
 
 
332 aa  349  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4149  formamidase  49.85 
 
 
332 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3954  formamidase  49.85 
 
 
332 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4041  formamidase  49.24 
 
 
332 aa  349  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1198  formamidase  49.24 
 
 
332 aa  346  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1889  formamidase  48.8 
 
 
334 aa  345  8e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.138385  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2134  formamidase  46.11 
 
 
340 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2611  formamidase  45.48 
 
 
349 aa  315  8e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.351013  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4054  formamidase  57.79 
 
 
207 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.603683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0463  acylamide amidohydrolase  37.83 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.374834 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54969  aliphatic amidase  34.96 
 
 
357 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1842  acylamide amidohydrolase  38.49 
 
 
345 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849454  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0600  acylamide amidohydrolase  35.8 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298294  hitchhiker  0.0097347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1592  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  37.05 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4905  acylamide amidohydrolase  37.5 
 
 
345 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3372  acylamide amidohydrolase  35.91 
 
 
350 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.456501  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3681  acylamide amidohydrolase  35.91 
 
 
350 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1958  acylamide amidohydrolase  35.86 
 
 
345 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5504  acylamide amidohydrolase  35.91 
 
 
351 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3563  acylamide amidohydrolase  35.91 
 
 
370 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3614  acylamide amidohydrolase  36.51 
 
 
346 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.580069  normal  0.0659972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0135  acylamide amidohydrolase  36.14 
 
 
344 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5675  acylamide amidohydrolase  37.35 
 
 
341 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3641  acylamide amidohydrolase  36.51 
 
 
345 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369711  normal  0.0367769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3739  acylamide amidohydrolase  37.05 
 
 
341 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4629  acylamide amidohydrolase  37.05 
 
 
341 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3862  acylamide amidohydrolase  37.17 
 
 
348 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.897958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0571  acylamide amidohydrolase  36.84 
 
 
345 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3117  acylamide amidohydrolase  36.18 
 
 
347 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1942  Amidase  36.48 
 
 
345 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2141  acylamide amidohydrolase  33.94 
 
 
347 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2307  acylamide amidohydrolase  35.64 
 
 
347 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20560  acylamide amidohydrolase  34.54 
 
 
346 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000697662  normal  0.516157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1764  acylamide amidohydrolase  34.54 
 
 
346 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3773  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  93.68 
 
 
95 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.704804  normal  0.237267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4057  formamidase  37.1 
 
 
129 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4306  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.2 
 
 
275 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150232  hitchhiker  0.00451194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7479  putative hydrolase  29.65 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1638  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.56 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00765583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2944  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.57 
 
 
337 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2760  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  23.95 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2842  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.51 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4736  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  27.65 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.923409  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2095  N-carbamoyl-D-amino acid hydrolase  29.93 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4557  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  35.52 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2588  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.581907  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4372  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.34 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3994  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.34 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0715  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0406592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3063  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  28.76 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1822  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.47 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  26.9 
 
 
631 aa  79.3  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3529  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  33.71 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.714914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0736  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.24 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.034467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4821  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.97612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  30.05 
 
 
639 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0387  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.1 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5155  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0029  carbon-nitrogen family hydrolase  32.86 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3846  carbon-nitrogen hydrolase family protein  27.84 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0382  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.07 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2631  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  28.87 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498987  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0406  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.95 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0410  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.82 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04400  predicted amidohydrolase  29.96 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191256 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0408  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  28.24 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1311  putative carbon-nitrogen hydrolase  29.06 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.852346  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0211  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.652153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2839  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.12 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399421  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0421  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.19 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.534383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  27.36 
 
 
640 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1903  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.67 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00174651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1548  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.02 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17730  hypothetical protein  32.8 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1543  hypothetical protein  32.8 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2211  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.43 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3461  N-carbamyl-D-amino acid amidohydrolase  28.57 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4513  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.33 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142068  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1514  carbon-nitrogen hydrolase family protein  28.16 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1717  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.18 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2219  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.44 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal  0.654572 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3106  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0284757  normal  0.331755 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5694  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.5 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362224  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1242  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.89 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1255  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.31 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1176  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.66 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167072  normal  0.117907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0264  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.75 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2066  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.561833  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3416  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0379108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>