46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3773 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3773  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.704804  normal  0.237267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1114  formamidase  93.68 
 
 		 342 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2023  formamidase  86.32 
 
 		 342 aa  174  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0453204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1704  formamidase  85.26 
 
 		 342 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2925 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6454  formamidase  74.74 
 
 		 338 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37022  normal  0.0467155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1357  aliphatic amidase  64.89 
 
 		 338 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5655  formamidase  68.42 
 
 		 338 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1590  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  65.26 
 
 		 331 aa  130  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1166  formamidase  63.83 
 
 		 338 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.495916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45451  formamidase  64.52 
 
 		 342 aa  128  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4041  formamidase  30.93 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1198  formamidase  30.93 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3954  formamidase  30.93 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2134  formamidase  31.96 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4057  formamidase  30.93 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1889  formamidase  32.99 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.138385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4149  formamidase  30.93 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3699  formamidase  30.93 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3682  formamidase  30.93 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3851  formamidase  30.93 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2611  formamidase  32.99 
 
 		 349 aa  67  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.351013  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0463  acylamide amidohydrolase  31.18 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.374834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1842  acylamide amidohydrolase  35.96 
 
 		 345 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849454  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1958  acylamide amidohydrolase  30.11 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5504  acylamide amidohydrolase  31.18 
 
 		 351 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1592  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  33.71 
 
 		 347 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4905  acylamide amidohydrolase  33.71 
 
 		 345 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3117  acylamide amidohydrolase  32.58 
 
 		 347 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3614  acylamide amidohydrolase  31.18 
 
 		 346 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.580069  normal  0.0659972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5675  acylamide amidohydrolase  36.67 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0600  acylamide amidohydrolase  30.11 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298294  hitchhiker  0.0097347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1942  Amidase  33.7 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3739  acylamide amidohydrolase  36.67 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0135  acylamide amidohydrolase  32.58 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4629  acylamide amidohydrolase  36.67 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3862  acylamide amidohydrolase  33.33 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.897958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2307  acylamide amidohydrolase  34.83 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0571  acylamide amidohydrolase  31.18 
 
 		 345 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3681  acylamide amidohydrolase  29.03 
 
 		 350 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3372  acylamide amidohydrolase  29.03 
 
 		 350 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.456501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3563  acylamide amidohydrolase  30.34 
 
 		 370 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2141  acylamide amidohydrolase  32.58 
 
 		 347 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1764  acylamide amidohydrolase  33.71 
 
 		 346 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20560  acylamide amidohydrolase  32.58 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000697662  normal  0.516157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3641  acylamide amidohydrolase  29.21 
 
 		 345 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369711  normal  0.0367769 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54969  aliphatic amidase  28.57 
 
 		 357 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>