More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1704 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1114  formamidase  92.98 
 
 
342 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2023  formamidase  98.83 
 
 
342 aa  706    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0453204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1704  formamidase  100 
 
 
342 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.2925 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5655  formamidase  82.49 
 
 
338 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6454  formamidase  81.07 
 
 
338 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37022  normal  0.0467155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1166  formamidase  74.7 
 
 
338 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.495916  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1357  aliphatic amidase  73.48 
 
 
338 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1590  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  73.03 
 
 
331 aa  524  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45451  formamidase  71.56 
 
 
342 aa  506  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3851  formamidase  48.62 
 
 
332 aa  342  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3682  formamidase  48.62 
 
 
332 aa  342  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3699  formamidase  48.62 
 
 
332 aa  342  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4149  formamidase  48.62 
 
 
332 aa  342  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3954  formamidase  48.62 
 
 
332 aa  342  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4041  formamidase  48.01 
 
 
332 aa  342  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1889  formamidase  47.9 
 
 
334 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.138385  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1198  formamidase  48.01 
 
 
332 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2611  formamidase  44.86 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.351013  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2134  formamidase  45.48 
 
 
340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4054  formamidase  56 
 
 
207 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.603683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0463  acylamide amidohydrolase  38.16 
 
 
339 aa  219  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.374834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0600  acylamide amidohydrolase  37.17 
 
 
348 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298294  hitchhiker  0.0097347 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54969  aliphatic amidase  33.33 
 
 
357 aa  209  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1842  acylamide amidohydrolase  37.5 
 
 
345 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849454  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1592  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  36.45 
 
 
347 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3372  acylamide amidohydrolase  36.51 
 
 
350 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.456501  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3681  acylamide amidohydrolase  36.51 
 
 
350 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5504  acylamide amidohydrolase  36.18 
 
 
351 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3614  acylamide amidohydrolase  36.18 
 
 
346 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.580069  normal  0.0659972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3563  acylamide amidohydrolase  36.51 
 
 
370 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5675  acylamide amidohydrolase  36.86 
 
 
341 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1958  acylamide amidohydrolase  35.2 
 
 
345 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3739  acylamide amidohydrolase  36.56 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4629  acylamide amidohydrolase  36.56 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3641  acylamide amidohydrolase  36.18 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369711  normal  0.0367769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0135  acylamide amidohydrolase  35.24 
 
 
344 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3862  acylamide amidohydrolase  36.84 
 
 
348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.897958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4905  acylamide amidohydrolase  35.86 
 
 
345 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0571  acylamide amidohydrolase  35.53 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3117  acylamide amidohydrolase  34.87 
 
 
347 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1942  Amidase  34.74 
 
 
345 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2141  acylamide amidohydrolase  32.42 
 
 
347 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1764  acylamide amidohydrolase  34.21 
 
 
346 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20560  acylamide amidohydrolase  34.21 
 
 
346 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000697662  normal  0.516157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2307  acylamide amidohydrolase  33.66 
 
 
347 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3773  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  85.26 
 
 
95 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.704804  normal  0.237267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4057  formamidase  37.1 
 
 
129 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4306  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 
275 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150232  hitchhiker  0.00451194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7479  putative hydrolase  30.81 
 
 
295 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1638  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.8 
 
 
281 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00765583  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4736  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  26.46 
 
 
373 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.923409  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2944  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.79 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2760  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.79 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4557  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  35.52 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2588  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.581907  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3063  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  30.04 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4372  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.41 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3994  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.41 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2631  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  28.87 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2095  N-carbamoyl-D-amino acid hydrolase  28.83 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0715  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0406592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1822  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.86 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  28.01 
 
 
639 aa  79.7  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2842  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3846  carbon-nitrogen hydrolase family protein  30.14 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3529  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.714914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  25.76 
 
 
631 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4821  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.97612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4513  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.67 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142068  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0387  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.99 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1903  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.64 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00174651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1514  carbon-nitrogen hydrolase family protein  29.13 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0736  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.37 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.034467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0382  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.19 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0406  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.07 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2839  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.35 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399421  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2211  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.92 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0410  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.07 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1311  putative carbon-nitrogen hydrolase  28.68 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.852346  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0408  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  26.91 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17730  hypothetical protein  32.28 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0421  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.65 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.534383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1543  hypothetical protein  30.24 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5155  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.55 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1717  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.16 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  26.89 
 
 
640 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3416  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.03 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0379108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0211  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.652153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2219  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal  0.654572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1255  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.81 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1549  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.22 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2857  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.18 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.190038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0029  carbon-nitrogen family hydrolase  30.99 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214118  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04400  predicted amidohydrolase  28.27 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0684  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.530852 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5694  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.23 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362224  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1242  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.95 
 
 
404 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2741  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.73 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4266  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.86 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0707  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.37 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>