20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1633 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1633  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889709  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002933  hypothetical protein  56.1 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000731775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03015  hypothetical protein  54.55 
 
 		 167 aa  181  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1857  hypothetical protein  52.44 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.847404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2059  hypothetical protein  33.86 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1879  hypothetical protein  32.76 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2549  hypothetical protein  36.79 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625726  normal  0.0597268 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2012  hypothetical protein  32.69 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.526613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1823  hypothetical protein  30.94 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0926764  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2051  hypothetical protein  31.48 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178248  normal  0.1841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1856  hypothetical protein  31.86 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.335311  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4538  hypothetical protein  30.09 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2252  hypothetical protein  30.09 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.878451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2119  hypothetical protein  30.09 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.374625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2346  hypothetical protein  27.01 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2265  hypothetical protein  29.2 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.064698  normal  0.170534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2164  hypothetical protein  29.2 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.116483  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3169  hypothetical protein  27.27 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2500  hypothetical protein  36.54 
 
 		 162 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1918  hypothetical protein  32.74 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00132768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>