22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2252 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2252  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  322  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.878451  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4538  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  322  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2265  hypothetical protein  98.77 
 
 
162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.064698  normal  0.170534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2164  hypothetical protein  98.77 
 
 
162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.116483  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2119  hypothetical protein  98.15 
 
 
162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.374625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1856  hypothetical protein  80.86 
 
 
162 aa  267  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.335311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1918  hypothetical protein  81.48 
 
 
162 aa  256  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00132768  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2162  hypothetical protein  80.86 
 
 
162 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00149059  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2500  hypothetical protein  80.86 
 
 
162 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2057  hypothetical protein  79.63 
 
 
162 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  normal  0.852274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2012  hypothetical protein  58.39 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.526613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1879  hypothetical protein  53.99 
 
 
162 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2051  hypothetical protein  49.7 
 
 
167 aa  150  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178248  normal  0.1841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2549  hypothetical protein  55 
 
 
163 aa  150  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625726  normal  0.0597268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2346  hypothetical protein  48.77 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1823  hypothetical protein  46.91 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0926764  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2059  hypothetical protein  50.96 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002933  hypothetical protein  34.31 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000731775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1857  hypothetical protein  31.06 
 
 
168 aa  53.9  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.847404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03015  hypothetical protein  33.01 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3169  hypothetical protein  26.12 
 
 
205 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1633  hypothetical protein  30.09 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>