22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1879 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1879  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  329  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2012  hypothetical protein  56.52 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.526613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2265  hypothetical protein  53.99 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.064698  normal  0.170534 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4538  hypothetical protein  53.99 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2252  hypothetical protein  53.99 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.878451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2164  hypothetical protein  53.99 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.116483  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2119  hypothetical protein  53.37 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.374625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1856  hypothetical protein  54.49 
 
 		 162 aa  166  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.335311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2549  hypothetical protein  50.31 
 
 		 163 aa  157  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625726  normal  0.0597268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1918  hypothetical protein  53.37 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00132768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2162  hypothetical protein  52.15 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00149059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2057  hypothetical protein  52.15 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  normal  0.852274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2051  hypothetical protein  48.21 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178248  normal  0.1841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2500  hypothetical protein  53.5 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2346  hypothetical protein  46.34 
 
 		 183 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2059  hypothetical protein  45.45 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1823  hypothetical protein  40.74 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0926764  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1633  hypothetical protein  32.76 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03015  hypothetical protein  34.29 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3169  hypothetical protein  31.62 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002933  hypothetical protein  32.38 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000731775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1857  hypothetical protein  31.43 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.847404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>