18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1857 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1857  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.847404  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002933  hypothetical protein  55.62 
 
 
167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000731775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1633  hypothetical protein  52.44 
 
 
178 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03015  hypothetical protein  52.69 
 
 
167 aa  173  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2549  hypothetical protein  36.19 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625726  normal  0.0597268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2051  hypothetical protein  30.63 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178248  normal  0.1841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1879  hypothetical protein  31.43 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3169  hypothetical protein  30.56 
 
 
205 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4538  hypothetical protein  31.06 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2252  hypothetical protein  31.06 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.878451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1856  hypothetical protein  33.65 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.335311  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2119  hypothetical protein  33.98 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.374625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2164  hypothetical protein  33.01 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.116483  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2265  hypothetical protein  33.01 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.064698  normal  0.170534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1918  hypothetical protein  33.58 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00132768  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2500  hypothetical protein  35.92 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1823  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0926764  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2057  hypothetical protein  35.92 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  normal  0.852274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>