22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03015 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03015  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  342  8.999999999999999e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002933  hypothetical protein  89.76 
 
 
167 aa  311  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000731775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1633  hypothetical protein  54.55 
 
 
178 aa  190  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889709  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1857  hypothetical protein  52.69 
 
 
168 aa  186  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.847404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2012  hypothetical protein  35.29 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.526613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2549  hypothetical protein  29.37 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625726  normal  0.0597268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1879  hypothetical protein  34.29 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2059  hypothetical protein  34.78 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2051  hypothetical protein  29.73 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178248  normal  0.1841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1856  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.335311  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2252  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.878451  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4538  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2119  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.374625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2164  hypothetical protein  32.35 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.116483  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2265  hypothetical protein  32.35 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.064698  normal  0.170534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2346  hypothetical protein  31.43 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3169  hypothetical protein  41.43 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1823  hypothetical protein  29.11 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0926764  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1918  hypothetical protein  29.91 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00132768  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2162  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00149059  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2057  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  normal  0.852274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2500  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>