52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0687 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0687  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 436 aa  904    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0396  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  45.5 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3956  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.79 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1020  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.9 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.44 
 
 		 424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2806  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.77 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.639346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.95 
 
 		 419 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2629  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.95 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.469709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2421  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.95 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2525  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.95 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.95 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4147  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.65 
 
 		 420 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2624  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.24 
 
 		 419 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02127  hypothetical protein  38.24 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2383  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.24 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02168  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38.24 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3379  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  38 
 
 		 419 aa  269  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.32 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2394  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.77 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3990  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.84 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.523748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0566  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.84 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1409  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.77 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.665816 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1417  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  37.77 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2540  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.59 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0228  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.61 
 
 		 424 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0249  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.47 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.084897  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  33.02 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.171516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2843  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.74 
 
 		 420 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.48 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0070  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.61 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1520  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.5 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0570391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3389  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.44 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4112  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.41 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.889687  normal  0.0200545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1437  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.21 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2517  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.02 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3498  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.99 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  28.57 
 
 		 442 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1229  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  25 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3300  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.93 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  26.12 
 
 		 449 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1124  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  25.64 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2101  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  25.79 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2531  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.54 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1318  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  25.86 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1337  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.55 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.766172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1420  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  25.63 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1971  dihydrolipoamide dehydrogenase  60 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46620  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.53 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410567  hitchhiker  0.00000263781 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1577  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.22 
 
 		 473 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  52.5 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1610  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.22 
 
 		 473 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184243  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  41.89 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>