53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3956 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4147  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  93.57 
 
 		 420 aa  767    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3956  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 420 aa  845    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0249  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  62.35 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.084897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  63.07 
 
 		 416 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3990  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  59.34 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.523748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0566  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  59.1 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  57.69 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0228  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  58.63 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2806  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  48.56 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.639346 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2421  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.88 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.88 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2525  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.88 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.88 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2629  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.88 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.469709 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1409  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.64 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.665816 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1417  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  49.64 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2394  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02168  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2383  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02127  hypothetical protein  49.4 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2624  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2540  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  49.4 
 
 		 419 aa  359  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3379  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  48.67 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  41.16 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.171516  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0687  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.79 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0396  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  33.11 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1020  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  33.33 
 
 		 446 aa  236  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0070  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  32.08 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4112  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  32.94 
 
 		 414 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.889687  normal  0.0200545 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2101  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.27 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.48 
 
 		 430 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3389  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.24 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3300  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  30.19 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2843  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.7 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580036  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2517  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.68 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  30.41 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1437  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.06 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3498  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.21 
 
 		 432 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1520  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.88 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0570391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  28.67 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1124  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.64 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1229  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  25.54 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2531  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  31.14 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1318  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  30.25 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1420  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.73 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1337  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  29.02 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.766172 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5492  putative succinate dehydrogenase  32.38 
 
 		 567 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  30.14 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.02 
 
 		 561 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.125425  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1191  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.65 
 
 		 205 aa  43.5  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.015621  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  35.9 
 
 		 509 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  29.79 
 
 		 369 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  35.9 
 
 		 509 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>