17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0102 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1999  hypothetical protein  53.61 
 
 		 193 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2217  hypothetical protein  51.55 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.257922 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3193  hypothetical protein  44.81 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.258908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1590  hypothetical protein  39.57 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1414  hypothetical protein  39.38 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34333  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2773  hypothetical protein  39.39 
 
 		 214 aa  121  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.669371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0939  hypothetical protein  39.87 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3423  hypothetical protein  39.87 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3548  hypothetical protein  39.87 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3351  hypothetical protein  39.87 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1687  hypothetical protein  32.8 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.91613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  37.7 
 
 		 405 aa  85.9  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  35.25 
 
 		 418 aa  68.2  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 820 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  25.38 
 
 		 817 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  25.38 
 
 		 817 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>