17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3351 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3351  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3423  hypothetical protein  99.46 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3548  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0939  hypothetical protein  99.46 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1687  hypothetical protein  43.65 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.91613  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0102  hypothetical protein  39.87 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1999  hypothetical protein  36.61 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2217  hypothetical protein  36.07 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.257922 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3193  hypothetical protein  35.14 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.258908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  30.97 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1414  hypothetical protein  28.33 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34333  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  28.65 
 
 		 418 aa  67.8  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1590  hypothetical protein  27.45 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2773  hypothetical protein  27.43 
 
 		 214 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.669371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  23.78 
 
 		 817 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  23.78 
 
 		 817 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1207  histidine kinase  25.25 
 
 		 577 aa  44.7  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>