16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1687 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1687  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  363  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.91613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0939  hypothetical protein  46.88 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3548  hypothetical protein  46.25 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3351  hypothetical protein  46.25 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3423  hypothetical protein  45.62 
 
 
184 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3193  hypothetical protein  38.61 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.258908  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0102  hypothetical protein  32.8 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1999  hypothetical protein  30.05 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277173  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2217  hypothetical protein  29.74 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  30.65 
 
 
405 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1590  hypothetical protein  29.66 
 
 
186 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2773  hypothetical protein  29.63 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.669371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1414  hypothetical protein  29.25 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34333  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  26.92 
 
 
817 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  26.92 
 
 
817 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  28.06 
 
 
418 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>