17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0939 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0939  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3351  hypothetical protein  99.46 
 
 
184 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3423  hypothetical protein  98.91 
 
 
184 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3548  hypothetical protein  99.46 
 
 
184 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1687  hypothetical protein  44.2 
 
 
181 aa  150  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.91613  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0102  hypothetical protein  39.87 
 
 
186 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1999  hypothetical protein  36.61 
 
 
193 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277173  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2217  hypothetical protein  37.16 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257922 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3193  hypothetical protein  35.14 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.258908  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  30.97 
 
 
405 aa  72  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1414  hypothetical protein  28.33 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34333  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  28.12 
 
 
418 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1590  hypothetical protein  27.45 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2773  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.669371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  23.17 
 
 
817 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  23.17 
 
 
817 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1207  histidine kinase  25.25 
 
 
577 aa  44.7  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>