15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3193 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3193  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.258908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0102  hypothetical protein  44.81 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2217  hypothetical protein  44.21 
 
 		 193 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.257922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1999  hypothetical protein  44.85 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1414  hypothetical protein  33.15 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34333  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1590  hypothetical protein  33.15 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3423  hypothetical protein  37.58 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0939  hypothetical protein  36.94 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3548  hypothetical protein  36.94 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3351  hypothetical protein  36.94 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2773  hypothetical protein  35.95 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.669371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1687  hypothetical protein  38.61 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.91613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  35.94 
 
 		 405 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  32.37 
 
 		 418 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 		 820 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.452141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>