15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1590 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1590  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1414  hypothetical protein  80.65 
 
 
196 aa  313  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34333  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1999  hypothetical protein  39.55 
 
 
193 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277173  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2217  hypothetical protein  37.99 
 
 
193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257922 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0102  hypothetical protein  39.57 
 
 
186 aa  131  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3193  hypothetical protein  33.15 
 
 
189 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.258908  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2773  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.669371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  32.23 
 
 
405 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0939  hypothetical protein  27.63 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3423  hypothetical protein  27.63 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3548  hypothetical protein  27.63 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3351  hypothetical protein  27.63 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1687  hypothetical protein  29.66 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.91613  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1207  histidine kinase  22.94 
 
 
577 aa  42.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  23.45 
 
 
418 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>