15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1414 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1414  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34333  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1590  hypothetical protein  80.65 
 
 
186 aa  313  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1999  hypothetical protein  39.15 
 
 
193 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277173  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2217  hypothetical protein  37.84 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257922 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0102  hypothetical protein  39.38 
 
 
186 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3193  hypothetical protein  33.15 
 
 
189 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.258908  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2773  hypothetical protein  31.55 
 
 
214 aa  91.7  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.669371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3423  hypothetical protein  30.26 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3548  hypothetical protein  30.26 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3351  hypothetical protein  30.26 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0939  hypothetical protein  30.26 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  28.22 
 
 
405 aa  68.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1687  hypothetical protein  29.25 
 
 
181 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.91613  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1207  histidine kinase  28.74 
 
 
577 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  25.66 
 
 
418 aa  41.2  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>