16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2773 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2773  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.669371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1999  hypothetical protein  39.02 
 
 		 193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2217  hypothetical protein  37.17 
 
 		 193 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.257922 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0102  hypothetical protein  39.39 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1590  hypothetical protein  32.24 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3193  hypothetical protein  35.95 
 
 		 189 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.258908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1414  hypothetical protein  31.55 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34333  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3423  hypothetical protein  30.43 
 
 		 184 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0939  hypothetical protein  30.67 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3548  hypothetical protein  30.43 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3351  hypothetical protein  30.43 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  32.74 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1687  hypothetical protein  29.63 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.91613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3102  hypothetical protein  32.23 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  23.66 
 
 		 817 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  23.66 
 
 		 817 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>