13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0548 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0548  30S ribosomal protein S26e  100 
 
 		 97 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1945  30S ribosomal protein S26e  64.13 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1922  30S ribosomal protein S26e  57.14 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1636  Ribosomal protein S26E  56.04 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0820  30S ribosomal protein S26e  61.8 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.820029  normal  0.037836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1091  30S ribosomal protein S26e  59.55 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0802  30S ribosomal protein S26e  60.67 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0108908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1365  30S ribosomal protein S26e  58.43 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0923  30S ribosomal protein S26e  48.31 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14364  Ribosomal protein S26, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.63 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05715  40S ribosomal protein S26E (Broad)  31.25 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77120  40S small subunit ribosomal protein S26A  29.79 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0450387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30160  predicted protein  29.03 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>