14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1636 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1636  Ribosomal protein S26E  100 
 
 
95 aa  193  6e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1922  30S ribosomal protein S26e  87.23 
 
 
95 aa  172  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1945  30S ribosomal protein S26e  61.54 
 
 
152 aa  120  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0548  30S ribosomal protein S26e  56.04 
 
 
97 aa  105  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1091  30S ribosomal protein S26e  62.11 
 
 
100 aa  100  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0820  30S ribosomal protein S26e  63.16 
 
 
98 aa  100  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.820029  normal  0.037836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0802  30S ribosomal protein S26e  62.11 
 
 
98 aa  98.2  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0108908  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1365  30S ribosomal protein S26e  60 
 
 
98 aa  96.7  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0923  30S ribosomal protein S26e  46.32 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77120  40S small subunit ribosomal protein S26A  32.98 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0450387  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05715  40S ribosomal protein S26E (Broad)  32.99 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14364  Ribosomal protein S26, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.29 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30160  predicted protein  32.98 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01770  hypothetical protein  30.59 
 
 
132 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.448001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>