14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0923 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0923  30S ribosomal protein S26e  100 
 
 
95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1922  30S ribosomal protein S26e  48.94 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1636  Ribosomal protein S26E  46.32 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0548  30S ribosomal protein S26e  48.31 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1945  30S ribosomal protein S26e  43.96 
 
 
152 aa  87  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77120  40S small subunit ribosomal protein S26A  44.21 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0450387  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1091  30S ribosomal protein S26e  47.37 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0802  30S ribosomal protein S26e  44.21 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0108908  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0820  30S ribosomal protein S26e  45.26 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.820029  normal  0.037836 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05715  40S ribosomal protein S26E (Broad)  41.49 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1365  30S ribosomal protein S26e  44.21 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30160  predicted protein  33.68 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14364  Ribosomal protein S26, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.61 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01770  hypothetical protein  43.48 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.448001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>