13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1091 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1091  30S ribosomal protein S26e  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0820  30S ribosomal protein S26e  94.9 
 
 		 98 aa  167  5e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.820029  normal  0.037836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1365  30S ribosomal protein S26e  92.86 
 
 		 98 aa  166  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0802  30S ribosomal protein S26e  88.78 
 
 		 98 aa  159  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0108908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1945  30S ribosomal protein S26e  71.28 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1922  30S ribosomal protein S26e  64.89 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1636  Ribosomal protein S26E  62.11 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0548  30S ribosomal protein S26e  59.55 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0923  30S ribosomal protein S26e  47.37 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05715  40S ribosomal protein S26E (Broad)  35.71 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77120  40S small subunit ribosomal protein S26A  34.65 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0450387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14364  Ribosomal protein S26, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  33 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30160  predicted protein  30.93 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>