14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77120 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_77120  40S small subunit ribosomal protein S26A  100 
 
 
119 aa  240  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0450387  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05715  40S ribosomal protein S26E (Broad)  72.65 
 
 
119 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30160  predicted protein  63 
 
 
104 aa  134  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01770  hypothetical protein  69.61 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.448001  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14364  Ribosomal protein S26, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  59.09 
 
 
114 aa  130  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0923  30S ribosomal protein S26e  44.21 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1922  30S ribosomal protein S26e  35.42 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1945  30S ribosomal protein S26e  36.08 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1636  Ribosomal protein S26E  32.98 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0548  30S ribosomal protein S26e  29.79 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1091  30S ribosomal protein S26e  34.65 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0820  30S ribosomal protein S26e  32 
 
 
98 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.820029  normal  0.037836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0802  30S ribosomal protein S26e  32.67 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0108908  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1365  30S ribosomal protein S26e  31.68 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>