43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4140 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
195 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2887  hypothetical protein  42.69 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  44.32 
 
 
222 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  37.02 
 
 
208 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  37.36 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  36.98 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  31.13 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22160  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.17 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  35.39 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  45.57 
 
 
86 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  34.08 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0071  putative acetyltransferase  34.43 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  27.53 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
218 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3570  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4223  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5751  GCN5-related N-acetyltransferase  40.43 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
215 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  32.66 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  27.37 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2359  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.687437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  32.42 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  28.28 
 
 
203 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  23.27 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  26.26 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  26.15 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  49.35 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000377635  hitchhiker  0.00000000073104 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  22.6 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58555  predicted protein  38.71 
 
 
267 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  35.48 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  27.23 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4434  hypothetical protein  29.3 
 
 
194 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>