40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1182 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  100 
 
 
199 aa  407  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  49.14 
 
 
192 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0524731  hitchhiker  0.000628813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5716  hypothetical protein  52.05 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  26.11 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  28.82 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  26.82 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12068  hypothetical protein  21.76 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  22.67 
 
 
209 aa  52  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  22.81 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  23.68 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  22.16 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  22.51 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  20.22 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  26.44 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
194 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  21.08 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  23.75 
 
 
200 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0865  hypothetical protein  21.11 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  22.09 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2298  GCN5-related N-acetyltransferase  27.18 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019963  hitchhiker  0.00182548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  22.93 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  22.54 
 
 
213 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  26.02 
 
 
156 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0758603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  22.99 
 
 
216 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  20.97 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_847  acetyltransferase  20.93 
 
 
221 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0198431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1367  acetyltransferase, GNAT family  31.88 
 
 
148 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.027208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0988  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803584  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
86 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>