52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_848 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  100 
 
 
209 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  85.17 
 
 
209 aa  383  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  76.08 
 
 
209 aa  341  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0974  puromycin N-acetyltransferase,-like protein  33.84 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 
208 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_847  acetyltransferase  32.83 
 
 
221 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0198431  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0865  hypothetical protein  31.82 
 
 
221 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  31.71 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  24.88 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  24.12 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  24.12 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  25.74 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12470  acetyltransferase (GNAT) family protein  25.14 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  26.11 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  24.51 
 
 
200 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  23.2 
 
 
215 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  33 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
86 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4140  GCN5-related N-acetyltransferase  27.53 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3916  acetyltransferase, GNAT family protein  22.94 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269539  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1732  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250464  decreased coverage  0.000848982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  23.83 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10238  acetyltransferase, GNAT family family (AFU_orthologue; AFUA_4G09540)  23.15 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0669  hypothetical protein  25.84 
 
 
221 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000996986  hitchhiker  0.0000110062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3974  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0613301  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1748  GCN5-related N-acetyltransferase  23.39 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.280538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3887  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35640  acetyltransferase  26.83 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3915  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000377635  hitchhiker  0.00000000073104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  25.91 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  hitchhiker  0.00358603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  23.87 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25650  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  33.33 
 
 
331 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5716  hypothetical protein  30.65 
 
 
75 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  30.56 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0411  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
158 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0206726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1691  hypothetical protein  24.14 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1469  GCN5-related N-acetyltransferase  20.37 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5751  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
187 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
320 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3310  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
186 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.25 
 
 
158 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.25 
 
 
158 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04993  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09940)  38.89 
 
 
213 aa  41.6  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0636839 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2480  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
159 aa  41.2  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>